Ο Ιωάννης Στέφος γεννήθηκε στη Θεσσαλονίκη. Σπούδασε βιολοντσέλο με τον Ρένο Μπαλτά στο Κρατικό Ωδείο Θεσσαλονίκης και με τους J.F. Sellheim και K. Heitz στην Ανώτατη Σχολή Μουσικής και Θεάτρου του Αννοβέρου (Hochschule für Musik und Theater Hannover), ενώ ειδικεύθηκε και στη διδασκαλία του βιολοντσέλου. Κατά τη διάρκεια των σπουδών του υπήρξε υπότροφος του Yamaha Music Foundation (1992), του Συλλόγου «Οι Φίλοι της Μουσικής» (κληροδότημα Κυβέλης – Γιάννη Χορν, 1993–1995, και Αλ. Τριάντη, 1998–2000) και του Ιδρύματος Κρατικών Υποτροφιών (ΙΚΥ, 1995–1997). Έχει αποσπάσει επανειλημμένα Α΄ βραβεία σε εθνικούς διαγωνισμούς βιολοντσέλου (ΣΑΩΘ, Φ. Νάκας κ.ά.), καθώς και μουσικής δωματίου (Helexpo). Από το 2001 είναι μόνιμο μέλος της Κρατικής Ορχήστρας Θεσσαλονίκης. Διδάσκει στο Ωδείο Βορείου Ελλάδος και στο Νέο Ωδείο Θεσσαλονίκης.